34份黄秋葵种质资源遗传多样性的iPBS分析
分类： 发表与出版
发布于：2021-8-14 12:00
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34份黄秋葵种质资源遗传多样性的iPBS分析
分子植物育种. 2021(15)
为了探讨黄秋葵种质资源间的遗传关系，本研究利用引物结合位点扩增(inter-primer binding site, iPBS)标记对34份秋葵种质进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果显示，12条iPBS引物共扩增出122条谱带，其中多态性谱带105条，多态性比率为80.45%。运用PopGene 32软件计算得到34份种质资源的有效等位基因数(Ne)范围为1.650 9～1.989 9，平均值为1.907 4；Nei’s基因指数(H)范围为0.394 3～0.497 5，平均值为0.474 6；Shannon’s信息指数(I)范围为0.583 3～0.690 6，平均值为0.667 3；这些参数表明黄秋葵具有丰富的遗传多样性，且遗传变异水平较高。采用NTsys 2.10e软件计算得到34份秋葵种质间的遗传相似系数在0.393 6～0.952 4之间。非加权组平均法(UPGMA)聚类结果表明，以遗传相似系数0.76为阈值，可将34份黄秋葵种质材料划分为6个组(Ⅰ, Ⅱ, Ⅲ, Ⅳ, Ⅴ和Ⅵ)，其中，在遗传相似系数大概为0.78处，Ⅱ类又可分为4个亚类有20份种质；各种质之间的亲缘关系与地理来源有一定的相关性，但不完全一致，材料间存在交叉现象。研究结果表明，iPBS技术可用于黄秋葵种质的鉴别以及遗传多态性的研究。本研究为黄秋葵资源的有效利用、遗传育种中亲本组合选配提供参考。
分子植物育种. 2021(15)
为了探讨黄秋葵种质资源间的遗传关系，本研究利用引物结合位点扩增(inter-primer binding site, iPBS)标记对34份秋葵种质进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果显示，12条iPBS引物共扩增出122条谱带，其中多态性谱带105条，多态性比率为80.45%。运用PopGene 32软件计算得到34份种质资源的有效等位基因数(Ne)范围为1.650 9～1.989 9，平均值为1.907 4；Nei’s基因指数(H)范围为0.394 3～0.497 5，平均值为0.474 6；Shannon’s信息指数(I)范围为0.583 3～0.690 6，平均值为0.667 3；这些参数表明黄秋葵具有丰富的遗传多样性，且遗传变异水平较高。采用NTsys 2.10e软件计算得到34份秋葵种质间的遗传相似系数在0.393 6～0.952 4之间。非加权组平均法(UPGMA)聚类结果表明，以遗传相似系数0.76为阈值，可将34份黄秋葵种质材料划分为6个组(Ⅰ, Ⅱ, Ⅲ, Ⅳ, Ⅴ和Ⅵ)，其中，在遗传相似系数大概为0.78处，Ⅱ类又可分为4个亚类有20份种质；各种质之间的亲缘关系与地理来源有一定的相关性，但不完全一致，材料间存在交叉现象。研究结果表明，iPBS技术可用于黄秋葵种质的鉴别以及遗传多态性的研究。本研究为黄秋葵资源的有效利用、遗传育种中亲本组合选配提供参考。